Hallo,
generell würde ich das Taxi der Metro vorziehen. Taxifahren ist wirklcih sehr günstig in Dubai.
Vom Sofitel zur Dubai Mall zahlt man in der Regel etwa zwischen 10-15 EURO, je nach Verkehrslage.
Einen organisierten Tagesausflug zum Burj Khalifa zu nehmen ist Unsinn.
Im Atlantis kommst Du nur gegen Eintritt in den Wasserpark, wenn Du nicht dort wohnst. Der Eintritt kostet ca. 45 EURO ohne Lost Chambers. Du solltest möglichst auch das arabische Wochenende meiden, da es dann sehr voll dort ist.
Ob man lieber in den WIld Wadi möchte oder in den Aquaventure hängt ein bißchen von den Vorlieben ab. Schau Dir einfach beide Parks auf der Homepage mal an.