Hallo,
wir waren letztes Jahr bei den Gilis schnorcheln, und haben vom Boot aus vor Gili Meno auch schöne Korallen und eine Schildkröte gesehen. Noch viel schöner war es aber (ohne Schildkröte) vor den kleinen Gilis im Süden (Nanggu etc.). Dort war unser bisher schönstes Schnorchelerlebnis.
Die Überfahrt mit einem Speedboat würde ich Dir aber absolut nicht empfehlen, vor allem Nachmittags wenn man zurück fährt gibt es schon ordentlich Wellengang und die Fahrt war sehr ruppig. Man kann aber auch von Bali nach Lombok fliegen, der Flughafen dort ist von den "kleinen" Gilis auch nicht so weit entfernt.
Dieses Jahr werden wir auf Bali in der "Blue Lagoon" schnorcheln, auf Bildern und Videos sah das sehr gut aus, aber dort kommen wohl viele Ausflügler hin. Da wir erst nächsten Monat da sind, kann ich es noch nicht wirklich vergleichen zu den Gilis, aber Du kannst Dir Bilder und Videos auf Youtube anschauen. Die Blue Lagoon liegt direkt bei Padang Bai an der Ostküste, und ist damit den Touristenzentren näher gelegen.
Vor Nusa Penida soll man auch gut schnorcheln können, dort sieht man wohl auch Mantas und Mondfische. Aber dort musst Du auch mit dem Boot hin, und ich kann auch noch nicht aus eigener Erfahrung berichten.