ahoj!
also, die strecke trnava - nitra kostet ca. 2,50 euro (also ca. 5 euro "sem tam")!
und einen (besseren) überblick über alle verbindungen (bahn UND bus) findest du hier:
cp.atlas.sk/vlakbus/spojenie/

buchung im voraus in österreich geht natürlich nicht, aber in sk kannst du problemlos auch im zug bezahlen!
mbg
p.

ahoj revi54!
also, das o.a. "dorint don giovanni" ist sicherlich keine schlechte wahl, zudem es nicht nur preislich in ordnung ist, sondern auch verkehrstechnisch günstig liegt: die u-bahn befindet sich direkt vor der haustüre (linie a, zelivskeho), und (was in prag fast noch wichtiger ist) liegt es auch an der strecke von 2 nacht-straßenbahnlinien (51,58) - netztickets gibt es übrigens für 3 tage (330 czk/~14 euro) oder für 5 tage (500 czk/~21 euro) - mit beiden kann man auch die nachtlinien UND die standseilbahn auf den "petrin" (aussichtsturm) benutzen.
was die sehenswürdigkeiten angeht, kann man eigentlich keine übersehen, da alle relativ nah beeinander liegen, und auch leicht zu fuß erreichbar sind.
abraten würde ich euch von einer flussfahrt auf der moldau - das ist eine reine touristen-******* und es gibt dabei auch nicht wirklich viel zu sehen.

als gruppe ganz witzig kann dafür abends ein besuch in einem "cerne divadlo" (schwarzes theater) sein - das beste (mit dem bekanntesten jazz-club der stadt im anschluss) findet ihr hier: www.redutajazzclub.cz/program_en.html#divadlo
als so große gruppe würde ich euch zudem dringend empfehlen, abends in restaurants stets einen tisch zu reservieren bzw. rechtzeitig loszuziehen (die tschechen essen abends nämlich traditionell schon etwas früher, so ab 19h) - im zentrum ist´s abends jedoch grundsätzlich immer ziemlich überfüllt. eine gute alternative habt ihr aber in der nähe des hotels im stadtteil "vinohrady" - entlang der straße "vinohradska" und rund um den "namesti miru" finden sich viele gute, einheimische lokale & restaurants (z.b.: www.uposty.cz )!
lasst euch zudem ja nicht von den vielen "keller-lokalen" abschrecken - da findet man (wie übrigens fast überall in cz & sk) oft wahre kleinodien darunter, wie z.b. das hier: www.thepub.cz (praha 2, halkova 6)!

preji vam krasnou dovolenou v praze!
mbg
p.

sehr zu empfehlen ist folgende runde auf der "kleinseite":
mit der standseilbahn (bei tram-haltestelle "ujezd" - gratis mit mehrtagesticket) hinauf zum "petrinska rozhledna" (aussichtsturm in form des eiffelturms - beste aussicht auf prag), und danach weiter zu fuß durch den park zum "kloster strahov" (dort gibt´s auch ein nettes terrassen-cafe mit wunderbarer aussicht), und dann weiter hinüber zum "hradschin"! am weg dorthin (loretanske namesti 107/1) findet man übrigens eine der besten "pivnice" von prag mit dem namen "u cerneho vola" (zum schwarzen ochsen) - sehr empfehlenswert (achtung, von außen ist sie nur durch ein kleines schild erkennbar, und wird daher von so gut wie allen touris übersehen)!
und gutes tschechisches futter in zentraler lage zu sehr günstigen preisen gibts hier (tgl. von 11-23h): 
http://www.hastalskydedek.cz/