Wir hatten auch das Problem mit der zu langen/ falschen PNR Nummer. Wir haben über Check 24 gebucht, Reiseveranstalter ist X TUI. Da wir mit 2 kleinen Kindern reisen, war es mir auch wichtig, dass wir zusammen sitzen. Bei uns wurde es folgendermaßen gelöst:

Circa 4 Wochen vor der Reise bekamen wir von Check 24 die endgültigen Reiseunterlagen. Dort stand für beide Flüge eine PNR/ Ticketnummer von Airtuerk (theoretisch zu lang). Wir konnten uns aber mit dieser über Airtuerk bei Pegasus einloggen und Sitzplätze für uns reservieren. Für diese mussten wir bezahlen, aber das ist mir das Beisammensitzen wert.