Hallo,
es gibt eigentlich 2 Hafen auf Santorin: am Faehrhafen Athinios wuerde ich vom Baden eigentlich eher abraten, weil durch die Faehren das Wasser dort nicht unbedingt das sauberste ist.
Am alten Hafen von Fira, wo nur Ausflugsboote anlegen, kann man vom Kai schon mal ins erfrischende Nass springen.
Ansonsten gibt es noch einige alte kleine Fischerhafen, die aber nur von den einheimischen Fischern genutzt werden, und ich daher eher ausschliesse, dass Du da baden willst.
Liebe Gruesse